淮南市体育学校前身为淮南市业余体校（创建于1977年），原隶属于淮南市体育局。2011年4月经市政府批准将原市属完全中学淮南八中整体划归原市体育局，成立了“学习、训练、食宿”三集中管理的淮南市体育学校，实现了“体教结合”的实体化。2018年9月，经市人民政府第18次常务会议研究同意，成立淮南市体育中等专业学校。
目前，学校具有九年义务教育、普通高中教育、中等职业教育三大块办学职能。开设有省体育局确定的重点建设类项目：田径、举重、赛艇、皮划艇；巩固强化类项目：武术散打、武术套路、橄榄球；改革发展类项目：篮球、足球、排球、乒乓球项目。
多年来，学校集合了原市属完全中学淮南第八中学的教学资源，按照“以体为本、读训并举”的办学思路，从措施上保证了青少年运动员的文化教育，也保证了竞技体育后备人才的可持续发展。至今在全市布点了10所“青少年单项体育后备人才基地”学校，进一步优化了全市青少年体育后备人才的培养体制。
学校创办以来，得益于上级主管部门的大力支持，得益于“体教结合”的后备人才培养模式，青少年体育工作呈现出良好的发展势头。
2013年8月，学校被国家体育总局授予“全国群众体育先进单位”；2014年2月，被省体育局命名为“安徽省高水平体育后备人才基地”；2014年9月，被省人力资源和社会保障厅、省体育局授予“全省体育系统先进集体”；2014年11月，被市委、市政府授予“淮南市第十六届市级文明单位”称号。同时，学校还关心和支持残疾人体育工作，被省残联、省体育局授予“2010—2014年全省残疾人体育工作先进单位”；2016年全国青少年“未来之星”阳光体育大会安徽分赛场优秀组织奖、活动展示二等奖、团体三等奖；2017年，被国家体育总局授予“国家高水平体育后备人才基地”称号，同年被教育部命名为国家社会科学基金“十二五”规划教育学重点课题“中华优秀传统文化教育研究实验学校”。
学校重视人才效益工作，把人才效益和人才质量摆在学校工作的重中之重，视人才质量和人才效益为学校发展的生命线。先后培养了一大批高水平竞技体育人才和体育工作者。学校成立至今，共培养了2个世界冠军、1个亚运会冠军、1个亚沙会冠军、9个全国冠军；12名运动员入选国家队。输送散打运动员耿全耀获得全国武术散打比赛冠军，赛艇运动员郭一柱、张国婷获得世界海岸赛艇沙滩冲刺赛总决赛冠军；同年参加2019年全国赛艇锦标赛获得一个第二名，两个第三名；张国婷参加二青会赛艇比赛获得第二名。皮划艇运动员王庆跨项冲浪，参加二青会冲浪项目获得了一个第二名，一个第三名。皮划艇运动员韦雅文参加二青会冲浪项目获得一个第三名，一个第六名。皮划艇运动员刘皖耀、王庆，参加2019年冲浪锦标赛获得两个第三名。